More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7805 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 395 aa  806    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  71.14 
 
 		 394 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  69.62 
 
 		 394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  69.62 
 
 		 394 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 398 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 398 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 390 aa  179  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 398 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 399 aa  176  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.76 
 
 		 386 aa  163  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 378 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 492 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 823 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 819 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 500 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 		 373 aa  130  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 500 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.07 
 
 		 838 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 413 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 806 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  25.91 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 816 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 816 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  27.6 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.82 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 377 aa  120  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 827 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 376 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 825 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 815 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 815 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.23 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 815 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 806 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.48 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.84 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  24.3 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 812 aa  112  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.57 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  28.57 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 385 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 843 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  27.32 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 805 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  28.53 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  25.77 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  25.77 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.86 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.315195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>