More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4803 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 399 aa  801    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  77.39 
 
 		 401 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  75.95 
 
 		 398 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  76.2 
 
 		 398 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  77.97 
 
 		 398 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  76.2 
 
 		 398 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 394 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.14 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 		 376 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 496 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 500 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 390 aa  144  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 442 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.35 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.72 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 385 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.17 
 
 		 423 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  28.5 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  28.5 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  28.12 
 
 		 413 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  27.97 
 
 		 412 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 378 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.07 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.68 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 819 aa  124  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.44 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.59 
 
 		 417 aa  123  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.82 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 386 aa  121  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5048  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.15 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.249273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.06 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.32 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.93 
 
 		 416 aa  120  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 385 aa  120  6e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3289  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.46 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2883  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.33 
 
 		 419 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723496  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 413 aa  116  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4131  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.04 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 816 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  26.34 
 
 		 415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 815 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.34 
 
 		 415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0046  sarcosine oxidase subunit beta  27.42 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.570395 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1600  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  27.42 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.323345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  25.68 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0996  sarcosine oxidase, beta subunit, putative  27.96 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.61 
 
 		 417 aa  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1954  sarcosine oxidase beta subunit  27.15 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.23 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0395  sarcosine oxidase, beta subunit  27.15 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 		 816 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1862  glycine/D-amino acid oxidases  27.15 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0945  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.47 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3504  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.69 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.68 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.52 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.23 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.52 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  25.41 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.23 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.52 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.52 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3333  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.61 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156184  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 812 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0486  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  27.15 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4546  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.15 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>