More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3229 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 391 aa  809    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  52.14 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  52.41 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  51.04 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  51.33 
 
 		 392 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  50.65 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  51.34 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  51.07 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  51.34 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  50.8 
 
 		 390 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  50.53 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  50.8 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  50.53 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  49.34 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  49.07 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  49.34 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  49.47 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  49.07 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  49.07 
 
 		 390 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  49.07 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  49.07 
 
 		 390 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  49.34 
 
 		 390 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  44.19 
 
 		 405 aa  343  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  43.4 
 
 		 394 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  43.15 
 
 		 394 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 385 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 385 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  32.52 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 373 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 381 aa  117  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 394 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 401 aa  106  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 816 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 500 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 500 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 496 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 		 816 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 416 aa  97.1  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 826 aa  96.7  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 823 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 825 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 416 aa  86.3  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 831 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 816 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  24.65 
 
 		 831 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  27.3 
 
 		 822 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 801 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  26.5 
 
 		 854 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 827 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 		 815 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 817 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 815 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 827 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>