More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3849 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
404 aa  805    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  41.05 
 
 
386 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3845  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
381 aa  240  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3868  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 
402 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0943449  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
399 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
398 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3020  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 
367 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.393882  normal  0.050284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
401 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 
398 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 
398 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
398 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 
382 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 
816 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
816 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
819 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  30.59 
 
 
822 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 
381 aa  87  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
390 aa  87  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1292  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
395 aa  86.3  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 
388 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
799 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
385 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  22.93 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0636  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188486  normal  0.91294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
816 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  29.75 
 
 
819 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
825 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
500 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
500 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
400 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.9 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
393 aa  77  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
830 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
830 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
496 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  24.24 
 
 
503 aa  76.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.74 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
812 aa  74.7  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
815 aa  73.6  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
843 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
604 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.51 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  27.13 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.05 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
397 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  24.59 
 
 
879 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 
830 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
806 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
835 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  29.67 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
823 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
513 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  27.68 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  27.66 
 
 
808 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4207  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.81852  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2102  D-amino-acid dehydrogenase  28.16 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 
806 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
835 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  23.15 
 
 
837 aa  66.6  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  22.72 
 
 
835 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.49 
 
 
821 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
817 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
388 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
434 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 
815 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>