More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1985 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
387 aa  780    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  39.63 
 
 
365 aa  285  7e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 
372 aa  270  2e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
382 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 
500 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
395 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
500 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
390 aa  189  9e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
496 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 
385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 
385 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 
388 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
382 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 
385 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
385 aa  171  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 
376 aa  169  7e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.86 
 
 
386 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
383 aa  169  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 
381 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 
373 aa  159  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 
392 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
413 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 
378 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  30.49 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 
378 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  28.17 
 
 
413 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 
413 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 
413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
413 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
412 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  27.99 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  25.71 
 
 
416 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  25.71 
 
 
416 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.97 
 
 
417 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4131  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.79 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
393 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.04 
 
 
416 aa  129  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.24 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.23 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
378 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  26.97 
 
 
415 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.97 
 
 
415 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0460  sarcosine oxidase, beta subunit  26.95 
 
 
416 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.57 
 
 
417 aa  123  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4713  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  26.68 
 
 
416 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0323  sarcosine oxidase, beta subunit family  25.53 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.968117  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0346  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.53 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4046  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.73 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0345  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.53 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  27.99 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4884  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.27 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66483 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5207  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  25.68 
 
 
416 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.09 
 
 
414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6204  sarcosine oxidase subunit beta  25.95 
 
 
416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194283  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0869  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.91 
 
 
417 aa  120  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3333  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.17 
 
 
414 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156184  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71470  sarcosine oxidase beta subunit  25.68 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115673  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  25.34 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.6 
 
 
417 aa  116  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
413 aa  116  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 
376 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3661  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.99 
 
 
417 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616865  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2487  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.23 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.58 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3216  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.36 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0868127  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5151  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.36 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.4 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1101  sarcosine oxidase subunit beta  25.82 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.163088 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3504  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.36 
 
 
414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0486  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  26.36 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5128  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.36 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68928  normal  0.839713 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5069  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.36 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4546  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.36 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5048  sarcosine oxidase, beta subunit family  25 
 
 
414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.249273 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0046  sarcosine oxidase subunit beta  25.54 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.570395 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
377 aa  113  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.72 
 
 
431 aa  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
394 aa  113  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 
394 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 
385 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3358  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.99 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.7 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.44 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  24.48 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.85 
 
 
417 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1600  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  25.82 
 
 
414 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.323345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>