More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0222 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 365 aa  743    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  56.99 
 
 		 372 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 500 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 500 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 496 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 492 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 382 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 390 aa  132  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 381 aa  129  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 385 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 413 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.09 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 385 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 413 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  27.42 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 413 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 393 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 413 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0945  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.59 
 
 		 418 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 428 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 394 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 390 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 394 aa  93.2  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3375  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.28 
 
 		 416 aa  92.8  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 378 aa  92.8  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.68 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  26.06 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  23.92 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.92 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.87 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  24.21 
 
 		 417 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.84 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.61 
 
 		 414 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4046  sarcosine oxidase beta subunit family protein  20.91 
 
 		 457 aa  87  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.41 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  25.54 
 
 		 374 aa  85.9  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.83 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  23.38 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2266  putative sarcosine oxidase, beta subunit  23.92 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  22.83 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2636  sarcosine oxidase, beta subunit family  23.14 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  23.9 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  23.57 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.62 
 
 		 431 aa  82.8  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  24.66 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.4 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.13 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  24.94 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  23.13 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.52 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  21.51 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  23.67 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.26 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2147  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.13 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  24.22 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3289  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.76 
 
 		 416 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  24.03 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  24.03 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3661  sarcosine oxidase, beta subunit family  23.3 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616865  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3358  sarcosine oxidase, beta subunit family  24.08 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  22.79 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>