More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0512 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  80.15 
 
 		 415 aa  715    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  79.42 
 
 		 414 aa  683    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  78.93 
 
 		 431 aa  705    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  80.15 
 
 		 415 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  100 
 
 		 423 aa  874    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  79.9 
 
 		 415 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5048  sarcosine oxidase, beta subunit family  58.84 
 
 		 414 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.249273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  57.83 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0046  sarcosine oxidase subunit beta  58.74 
 
 		 414 aa  485  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.570395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5069  sarcosine oxidase beta subunit family protein  58.84 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0486  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  58.84 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1600  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  58.84 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.323345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3504  sarcosine oxidase beta subunit family protein  58.6 
 
 		 414 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3661  sarcosine oxidase, beta subunit family  57.83 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616865  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3216  sarcosine oxidase beta subunit family protein  58.84 
 
 		 421 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0868127  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4546  sarcosine oxidase beta subunit family protein  58.84 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5128  sarcosine oxidase beta subunit family protein  58.84 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68928  normal  0.839713 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5151  sarcosine oxidase beta subunit family protein  58.84 
 
 		 421 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3774  sarcosine oxidase beta subunit  58.8 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1101  sarcosine oxidase subunit beta  59.08 
 
 		 414 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.163088 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3333  sarcosine oxidase beta subunit family protein  58.6 
 
 		 414 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156184  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4131  sarcosine oxidase beta subunit family protein  56.76 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  58.07 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3358  sarcosine oxidase, beta subunit family  57.83 
 
 		 417 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0996  sarcosine oxidase, beta subunit, putative  57.87 
 
 		 414 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2752  sarcosine oxidase beta subunit family protein  58.55 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  60.24 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  60 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  60 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1954  sarcosine oxidase beta subunit  57.38 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4830  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  58.35 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0395  sarcosine oxidase, beta subunit  57.38 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1862  glycine/D-amino acid oxidases  57.38 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5207  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  57.49 
 
 		 416 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  56.87 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  56.04 
 
 		 416 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  55.66 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0869  sarcosine oxidase beta subunit family protein  56.01 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6204  sarcosine oxidase subunit beta  56.52 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71470  sarcosine oxidase beta subunit  56.28 
 
 		 416 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  56.14 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2487  sarcosine oxidase beta subunit family protein  58.31 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  57 
 
 		 406 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  56.14 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  57.25 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0323  sarcosine oxidase, beta subunit family  56.28 
 
 		 416 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.968117  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  52.9 
 
 		 416 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  52.9 
 
 		 416 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0460  sarcosine oxidase, beta subunit  56.04 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0346  sarcosine oxidase beta subunit family protein  56.28 
 
 		 416 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4884  sarcosine oxidase beta subunit family protein  56.28 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0345  sarcosine oxidase beta subunit family protein  56.28 
 
 		 416 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  54.94 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4713  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  55.56 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  57.49 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3856  sarcosine oxidase subunit beta  55.81 
 
 		 408 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.014492  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2883  sarcosine oxidase, beta subunit family  54.96 
 
 		 419 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  55.22 
 
 		 412 aa  428  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4046  sarcosine oxidase beta subunit family protein  53.14 
 
 		 457 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0945  sarcosine oxidase beta subunit family protein  52.29 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3289  sarcosine oxidase beta subunit family protein  51.11 
 
 		 416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7233  sarcosine oxidase, beta subunit family  50.86 
 
 		 416 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0553602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1949  sarcosine oxidase, beta subunit  50.12 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5635  sarcosine oxidase, beta subunit family  51.6 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2636  sarcosine oxidase, beta subunit family  50.5 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2366  sarcosine oxidase beta subunit family protein  50.25 
 
 		 417 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5746  sarcosine oxidase beta subunit  50.62 
 
 		 416 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.267033  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  47.65 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1141  sarcosine oxidase beta subunit family protein  49.26 
 
 		 416 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3375  sarcosine oxidase beta subunit family protein  47.54 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1577  sarcosine oxidase, beta subunit family  48.89 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1936  sarcosine oxidase, beta subunit family  48.15 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1654  sarcosine oxidase beta subunit family protein  48.4 
 
 		 416 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2266  putative sarcosine oxidase, beta subunit  47.7 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3445  sarcosine oxidase beta subunit family protein  46.97 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.473565  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4700  sarcosine oxidase beta subunit family protein  47.65 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2147  sarcosine oxidase beta subunit family protein  46 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  44.15 
 
 		 413 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  43.61 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  43.88 
 
 		 413 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  44.13 
 
 		 413 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  43.19 
 
 		 413 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  41.52 
 
 		 413 aa  323  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  42.93 
 
 		 413 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  43.88 
 
 		 413 aa  316  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  42.12 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0222  sarcosine oxidase, beta subunit  55.78 
 
 		 258 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 390 aa  182  7e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 382 aa  182  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0220  sarcosine oxidase beta subunit  54.55 
 
 		 173 aa  180  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 500 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.3 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>