More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0222 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0222  sarcosine oxidase, beta subunit  100 
 
 
258 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  98.84 
 
 
417 aa  525  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  94.19 
 
 
417 aa  494  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  84.88 
 
 
417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  85.66 
 
 
417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  87.6 
 
 
417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0869  sarcosine oxidase beta subunit family protein  80.23 
 
 
417 aa  414  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  79.07 
 
 
417 aa  408  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  77.91 
 
 
417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  77.52 
 
 
417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  77.52 
 
 
417 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  77.52 
 
 
417 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3358  sarcosine oxidase, beta subunit family  77.13 
 
 
417 aa  400  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2487  sarcosine oxidase beta subunit family protein  77.91 
 
 
417 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3661  sarcosine oxidase, beta subunit family  75.58 
 
 
417 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616865  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2752  sarcosine oxidase beta subunit family protein  74.81 
 
 
417 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3774  sarcosine oxidase beta subunit  72.48 
 
 
417 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5048  sarcosine oxidase, beta subunit family  70.36 
 
 
414 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.249273 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0046  sarcosine oxidase subunit beta  72.73 
 
 
414 aa  364  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.570395 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3333  sarcosine oxidase beta subunit family protein  71.15 
 
 
414 aa  362  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156184  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0395  sarcosine oxidase, beta subunit  71.94 
 
 
414 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1954  sarcosine oxidase beta subunit  71.94 
 
 
414 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1862  glycine/D-amino acid oxidases  71.94 
 
 
414 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0996  sarcosine oxidase, beta subunit, putative  71.54 
 
 
414 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1600  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  71.15 
 
 
414 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.323345  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1101  sarcosine oxidase subunit beta  70.75 
 
 
414 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.163088 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4830  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  71.54 
 
 
414 aa  358  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3504  sarcosine oxidase beta subunit family protein  70.75 
 
 
414 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3216  sarcosine oxidase beta subunit family protein  70.75 
 
 
421 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0868127  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5151  sarcosine oxidase beta subunit family protein  70.75 
 
 
421 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5069  sarcosine oxidase beta subunit family protein  70.75 
 
 
414 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0486  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  70.75 
 
 
414 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4546  sarcosine oxidase beta subunit family protein  70.75 
 
 
414 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5128  sarcosine oxidase beta subunit family protein  70.75 
 
 
414 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68928  normal  0.839713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6204  sarcosine oxidase subunit beta  63.95 
 
 
416 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71470  sarcosine oxidase beta subunit  63.95 
 
 
416 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115673  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  62.02 
 
 
416 aa  338  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  62.02 
 
 
416 aa  338  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4131  sarcosine oxidase beta subunit family protein  62.79 
 
 
416 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0460  sarcosine oxidase, beta subunit  61.24 
 
 
416 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5207  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  61.63 
 
 
416 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4884  sarcosine oxidase beta subunit family protein  62.02 
 
 
416 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4713  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  61.24 
 
 
416 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0323  sarcosine oxidase, beta subunit family  61.63 
 
 
416 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.968117  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0345  sarcosine oxidase beta subunit family protein  61.63 
 
 
416 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0346  sarcosine oxidase beta subunit family protein  61.63 
 
 
416 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  62.55 
 
 
416 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2883  sarcosine oxidase, beta subunit family  57.75 
 
 
419 aa  315  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723496  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  58.14 
 
 
406 aa  310  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  57.75 
 
 
406 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  58.57 
 
 
415 aa  308  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  58.57 
 
 
415 aa  308  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  59.36 
 
 
415 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  59.46 
 
 
417 aa  306  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3856  sarcosine oxidase subunit beta  59.3 
 
 
408 aa  304  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.014492  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0945  sarcosine oxidase beta subunit family protein  55.04 
 
 
418 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943396  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  58.14 
 
 
412 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  57.77 
 
 
414 aa  298  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  55.78 
 
 
423 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4046  sarcosine oxidase beta subunit family protein  56.2 
 
 
457 aa  290  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  56.18 
 
 
431 aa  288  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1577  sarcosine oxidase, beta subunit family  56 
 
 
416 aa  287  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1949  sarcosine oxidase, beta subunit  56.4 
 
 
416 aa  284  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1654  sarcosine oxidase beta subunit family protein  56 
 
 
416 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1936  sarcosine oxidase, beta subunit family  55.6 
 
 
416 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3289  sarcosine oxidase beta subunit family protein  55.6 
 
 
416 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2636  sarcosine oxidase, beta subunit family  52.4 
 
 
416 aa  275  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  54.4 
 
 
416 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5746  sarcosine oxidase beta subunit  52.8 
 
 
416 aa  271  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.267033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1141  sarcosine oxidase beta subunit family protein  54.4 
 
 
416 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3375  sarcosine oxidase beta subunit family protein  53.2 
 
 
416 aa  267  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5635  sarcosine oxidase, beta subunit family  53.6 
 
 
416 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7233  sarcosine oxidase, beta subunit family  52.8 
 
 
416 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0553602 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3445  sarcosine oxidase beta subunit family protein  52.21 
 
 
417 aa  262  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.473565  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2366  sarcosine oxidase beta subunit family protein  51.6 
 
 
417 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4700  sarcosine oxidase beta subunit family protein  51.6 
 
 
417 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2266  putative sarcosine oxidase, beta subunit  52.42 
 
 
416 aa  258  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2147  sarcosine oxidase beta subunit family protein  55.78 
 
 
434 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  47.29 
 
 
413 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  47.39 
 
 
413 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  43.8 
 
 
412 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  46.4 
 
 
413 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  43.41 
 
 
413 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  41.43 
 
 
413 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  41.83 
 
 
413 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  42.29 
 
 
413 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  40.64 
 
 
413 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
381 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
382 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
383 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 
395 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
387 aa  98.2  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 
390 aa  97.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
382 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 
492 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
385 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 
496 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
500 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 
500 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
387 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>