More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3636 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
394 aa  796    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  43.47 
 
 
385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  44.6 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  45.08 
 
 
391 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 
377 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 
389 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  43.13 
 
 
389 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  45.21 
 
 
376 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 
389 aa  289  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  42.05 
 
 
378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 
394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  41.07 
 
 
376 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 
394 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  41.05 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  42.98 
 
 
375 aa  269  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  42.89 
 
 
380 aa  268  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  44.11 
 
 
384 aa  268  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 
383 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 
383 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 
383 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  41.71 
 
 
384 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  43.89 
 
 
394 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  42.97 
 
 
382 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  42.97 
 
 
382 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 
378 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 
388 aa  225  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 
374 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  42.24 
 
 
383 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
376 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
386 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 
390 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  32.43 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  32.7 
 
 
390 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 
393 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
983 aa  156  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 
984 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 
387 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 
385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
960 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  28.77 
 
 
447 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 
496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 
442 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 
382 aa  126  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
382 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  31.01 
 
 
378 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
492 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
395 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  26.64 
 
 
446 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 
398 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 
401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
385 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
444 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
444 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  27.01 
 
 
442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  27.01 
 
 
442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  27.01 
 
 
442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 
381 aa  116  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
442 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  27.01 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
389 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
389 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
455 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
378 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.65 
 
 
389 aa  112  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  25.61 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 
441 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  27.01 
 
 
436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 
441 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
397 aa  110  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
388 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
442 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  27.3 
 
 
382 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 
395 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 
445 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>