More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1168 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 372 aa  744    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  56.99 
 
 		 365 aa  451  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 492 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 500 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 500 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 395 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 413 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 383 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25 
 
 		 386 aa  126  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 381 aa  126  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 376 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 385 aa  125  8.000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 413 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  24.41 
 
 		 417 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 385 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  26.37 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 394 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 393 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.19 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  23.4 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.94 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.16 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3661  sarcosine oxidase, beta subunit family  24.67 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616865  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  25.45 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.45 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  23.14 
 
 		 417 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  22.87 
 
 		 417 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0945  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.73 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3358  sarcosine oxidase, beta subunit family  24.93 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  24.4 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 374 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 391 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.02 
 
 		 414 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0869  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.43 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2487  sarcosine oxidase beta subunit family protein  22.34 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  24.61 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.68 
 
 		 417 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  23.22 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  22.83 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.1 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  21.94 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.59 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2752  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.1 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  21.93 
 
 		 389 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.08 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 394 aa  92.8  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  22.4 
 
 		 378 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  22.37 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3375  sarcosine oxidase beta subunit family protein  22.51 
 
 		 416 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  22.64 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  23.3 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3774  sarcosine oxidase beta subunit  23.1 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  23.34 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  23.2 
 
 		 417 aa  90.1  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 378 aa  89.7  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 		 376 aa  89.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2266  putative sarcosine oxidase, beta subunit  22.43 
 
 		 416 aa  89.4  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4131  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.32 
 
 		 416 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  22.83 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.64 
 
 		 417 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  22.37 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  22.37 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  23.94 
 
 		 377 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1949  sarcosine oxidase, beta subunit  21.93 
 
 		 416 aa  86.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  20.49 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3289  sarcosine oxidase beta subunit family protein  21.11 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.5 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  20.38 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  23.3 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71470  sarcosine oxidase beta subunit  22.52 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>