More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0303 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 376 aa  751    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  82.66 
 
 		 377 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  75.2 
 
 		 384 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  69.65 
 
 		 385 aa  524  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  64.38 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  61.96 
 
 		 378 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  65.85 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  57.72 
 
 		 380 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  55.49 
 
 		 383 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  55.49 
 
 		 383 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  55.86 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  54.29 
 
 		 383 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  54.5 
 
 		 378 aa  359  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  55.74 
 
 		 375 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  55.32 
 
 		 382 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  55.44 
 
 		 382 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  47.31 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 		 389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  45.21 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  46.72 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  53.06 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  43.72 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 389 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  44.77 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  45.26 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  38.54 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  37.17 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  33.79 
 
 		 390 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 374 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 373 aa  171  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 396 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 983 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 984 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 387 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 392 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 960 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 823 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 383 aa  123  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 389 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 389 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 444 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 492 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.99 
 
 		 389 aa  110  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 500 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 385 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  28.81 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  28.81 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  28.81 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 843 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.71 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 		 442 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 442 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 		 441 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 430 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>