More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3709 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  82.21 
 
 		 442 aa  711    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  94.37 
 
 		 444 aa  817    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  82.21 
 
 		 442 aa  711    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  82.21 
 
 		 442 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  82.21 
 
 		 442 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  82.21 
 
 		 442 aa  711    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  81.98 
 
 		 442 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  82.21 
 
 		 442 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  93.02 
 
 		 444 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  80.59 
 
 		 436 aa  680    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  75.45 
 
 		 446 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 444 aa  894    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  95.05 
 
 		 455 aa  822    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  99.32 
 
 		 444 aa  888    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 444 aa  894    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  72.1 
 
 		 446 aa  628  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  72.99 
 
 		 446 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  35.39 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  37.64 
 
 		 447 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 442 aa  249  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  38.08 
 
 		 447 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  39.42 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 445 aa  242  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  38.18 
 
 		 443 aa  233  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  35.35 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 		 442 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  32.73 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 430 aa  226  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 441 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 446 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 451 aa  209  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 441 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 441 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  32.43 
 
 		 445 aa  203  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  34.37 
 
 		 431 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 		 441 aa  200  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 466 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  33.33 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 441 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  28.43 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 396 aa  143  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 378 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.51 
 
 		 386 aa  136  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 374 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 		 378 aa  130  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 385 aa  124  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  29.59 
 
 		 380 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 373 aa  121  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 385 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.33 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 496 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>