More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6361 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  90.02 
 
 		 441 aa  761    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  73.92 
 
 		 441 aa  650    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  95.92 
 
 		 441 aa  813    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  98.19 
 
 		 441 aa  874    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  86.62 
 
 		 441 aa  744    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 441 aa  887    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  96.15 
 
 		 441 aa  816    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  95.92 
 
 		 441 aa  813    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  76.64 
 
 		 466 aa  651    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  73.47 
 
 		 441 aa  631  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  70.52 
 
 		 441 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  71.88 
 
 		 441 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  72.79 
 
 		 441 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  65.76 
 
 		 441 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  68.1 
 
 		 439 aa  599  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  71.2 
 
 		 441 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  70.81 
 
 		 442 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  67.42 
 
 		 445 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  61.45 
 
 		 441 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  50.92 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  46.62 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  46.42 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  45.12 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  46.1 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 		 442 aa  349  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  39.5 
 
 		 442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  40.1 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  42.09 
 
 		 443 aa  309  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 		 446 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  41.41 
 
 		 447 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  38.21 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 447 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 431 aa  270  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  36.79 
 
 		 451 aa  266  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 431 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 430 aa  253  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 		 430 aa  243  6e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  34.91 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 446 aa  236  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  34.35 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  34.35 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  34.35 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  34.18 
 
 		 442 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 444 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 444 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 444 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 444 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 455 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 		 444 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  34.04 
 
 		 436 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 428 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 396 aa  147  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.05 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 395 aa  136  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  28.31 
 
 		 371 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 391 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  27.4 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.18 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 		 496 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 382 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 500 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  26.46 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>