More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1769 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  73.32 
 
 
442 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  73.32 
 
 
442 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  73.32 
 
 
442 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  82.74 
 
 
446 aa  734    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  73.32 
 
 
442 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  73.32 
 
 
442 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  73.54 
 
 
442 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  93.72 
 
 
446 aa  822    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  73.32 
 
 
442 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  909    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  72.77 
 
 
444 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  72.77 
 
 
444 aa  624  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  72.1 
 
 
444 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  72.1 
 
 
444 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  72.1 
 
 
455 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  72.32 
 
 
444 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  72.05 
 
 
436 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 
428 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  34.01 
 
 
460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 
442 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  38.52 
 
 
447 aa  250  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 
447 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  34.05 
 
 
442 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 
442 aa  246  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 
441 aa  243  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 
451 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  33.95 
 
 
443 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 
446 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 
430 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 
447 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 
443 aa  239  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 
445 aa  239  9e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 
442 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 
441 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  36.57 
 
 
430 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 
443 aa  236  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
423 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 
431 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
441 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
431 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 
433 aa  226  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 
444 aa  225  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 
441 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  33.41 
 
 
445 aa  222  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
441 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
441 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
439 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 
441 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 
441 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 
441 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  34.71 
 
 
441 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 
466 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 
442 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
471 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 
385 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
387 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
388 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
390 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 
392 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
378 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
396 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.46 
 
 
386 aa  143  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
385 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
374 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
382 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 
377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 
394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  29.09 
 
 
380 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
390 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  26.32 
 
 
390 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 
373 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
394 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 
983 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 
984 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 
376 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
378 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.25 
 
 
384 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  25.42 
 
 
377 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 
383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>