More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1927 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  100 
 
 		 441 aa  880    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  76.42 
 
 		 441 aa  633  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  72.34 
 
 		 441 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  74.83 
 
 		 441 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  73.92 
 
 		 441 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  69.16 
 
 		 439 aa  606  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  68.25 
 
 		 441 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  71.66 
 
 		 441 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  71.66 
 
 		 441 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  71.2 
 
 		 441 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  71.66 
 
 		 441 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  71.2 
 
 		 441 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  70.75 
 
 		 441 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  63.49 
 
 		 441 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  71.2 
 
 		 441 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  70.52 
 
 		 466 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  70.14 
 
 		 442 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  65.39 
 
 		 445 aa  568  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  58.5 
 
 		 441 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  46.31 
 
 		 460 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  49.32 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  47.58 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  45.12 
 
 		 442 aa  356  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 		 445 aa  351  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  43.36 
 
 		 442 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  38.78 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  41.59 
 
 		 443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  40.65 
 
 		 446 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 433 aa  279  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  40.91 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  40.74 
 
 		 447 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  40.74 
 
 		 447 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  40.23 
 
 		 444 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 451 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  39.53 
 
 		 431 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 430 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 		 447 aa  256  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 		 430 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  34.71 
 
 		 446 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 446 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 446 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  31.68 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  31.68 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  31.68 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  31.68 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 444 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  32.08 
 
 		 436 aa  200  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 423 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 471 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 496 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 394 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 816 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 389 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.9 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 816 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 389 aa  120  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 378 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  26.63 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.72 
 
 		 384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 394 aa  116  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  28.99 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>