More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1838 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  73.49 
 
 
430 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  78.14 
 
 
430 aa  693    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
430 aa  883    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  69.07 
 
 
431 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  65.58 
 
 
430 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  59.77 
 
 
431 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  43.54 
 
 
443 aa  335  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  41.58 
 
 
446 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  41.18 
 
 
442 aa  325  7e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  42.58 
 
 
444 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 
442 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  38.08 
 
 
460 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 
442 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  39.67 
 
 
433 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 
442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  39.03 
 
 
447 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 
443 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
447 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 
443 aa  280  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  38.61 
 
 
447 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 
441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  37.88 
 
 
441 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 
439 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  36.7 
 
 
445 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  36.87 
 
 
441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
445 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
442 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  36.3 
 
 
442 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  36.3 
 
 
442 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
442 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
442 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  36.3 
 
 
442 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  36.3 
 
 
442 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  36.01 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  36.15 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  35.81 
 
 
436 aa  253  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 
441 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 
451 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 
441 aa  250  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  34.37 
 
 
444 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 
441 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 
441 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  34.37 
 
 
455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 
441 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 
444 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
446 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 
441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 
441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 
466 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 
441 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  34.41 
 
 
441 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
471 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
423 aa  196  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
396 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 
387 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
390 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
394 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
385 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.19 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
389 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
392 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  26.57 
 
 
380 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  23.86 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
394 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
500 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 
381 aa  116  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  24.94 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
385 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 
385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25.55 
 
 
369 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 
385 aa  113  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.5 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.5 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 
816 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 
799 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  23.52 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.31 
 
 
369 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 
816 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.5 
 
 
369 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>