More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5001 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  73.47 
 
 		 441 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  68.48 
 
 		 441 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  73.92 
 
 		 441 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  74.66 
 
 		 442 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 441 aa  883    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  85.71 
 
 		 441 aa  726    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  72.34 
 
 		 439 aa  643    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  76.19 
 
 		 441 aa  665    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  90.48 
 
 		 441 aa  772    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  73.02 
 
 		 441 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  73.02 
 
 		 441 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  72.79 
 
 		 441 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  73.02 
 
 		 441 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  72.34 
 
 		 441 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  72.56 
 
 		 466 aa  623  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  74.83 
 
 		 441 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  71.46 
 
 		 445 aa  622  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  72.34 
 
 		 441 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  60.77 
 
 		 441 aa  555  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  47.8 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  51.04 
 
 		 441 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  46.64 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  46.37 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  44.65 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  42.76 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  39.68 
 
 		 442 aa  319  7.999999999999999e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  39.68 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  42.69 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  41.97 
 
 		 444 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  41.06 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 		 433 aa  296  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  42.01 
 
 		 447 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  42.01 
 
 		 447 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 		 451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 		 447 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  38.11 
 
 		 431 aa  266  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  36.95 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  33.64 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 446 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 446 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  32.24 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  32.24 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  32.24 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  32.24 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 455 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  31.84 
 
 		 436 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 388 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.65 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 385 aa  134  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 816 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 395 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.93 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.95 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 816 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  29.16 
 
 		 371 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 385 aa  126  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 382 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  27.2 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.67 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 496 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 500 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 394 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 		 394 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 500 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  28.16 
 
 		 371 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 395 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 492 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  21.92 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 387 aa  108  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  21.92 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>