More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4956 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 439 aa  872    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  71.69 
 
 		 445 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  72.62 
 
 		 442 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  72.56 
 
 		 441 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  73.92 
 
 		 441 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  70.52 
 
 		 441 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  72.34 
 
 		 441 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  65.99 
 
 		 441 aa  595  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  66.67 
 
 		 441 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  69.46 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  68.1 
 
 		 441 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  69.16 
 
 		 441 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  68.1 
 
 		 441 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  68.48 
 
 		 466 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  67.35 
 
 		 441 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  67.35 
 
 		 441 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  67.35 
 
 		 441 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  61.68 
 
 		 441 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  67.87 
 
 		 441 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  53.12 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  45.75 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  47.3 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  47.48 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  46.08 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  44.99 
 
 		 442 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  45.64 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  40.77 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  40.09 
 
 		 442 aa  316  6e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  41.69 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  41.42 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  42.49 
 
 		 447 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  40.32 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  42.49 
 
 		 447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  38.72 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  39.53 
 
 		 431 aa  265  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 447 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 		 430 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 		 431 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  33.8 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  33.8 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  33.8 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  33.26 
 
 		 442 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  33.26 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  33.49 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 444 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 446 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 455 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 428 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 394 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 378 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 394 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 496 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.78 
 
 		 384 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  28.44 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 816 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  22.49 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 816 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  25.59 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  29.4 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  27.67 
 
 		 380 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 799 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3375  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.36 
 
 		 416 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>