More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1578 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  87.92 
 
 		 447 aa  739    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  88.37 
 
 		 447 aa  743    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 447 aa  895    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  51 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  47.1 
 
 		 446 aa  348  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  45.58 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  44.34 
 
 		 442 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  43.24 
 
 		 442 aa  326  6e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  46.76 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  39.67 
 
 		 460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  43.03 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  39.6 
 
 		 430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  41.23 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  39.41 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  40.75 
 
 		 445 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 441 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  39.91 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  41.11 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  38.61 
 
 		 430 aa  279  9e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  38.02 
 
 		 430 aa  276  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  40.37 
 
 		 441 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  40.35 
 
 		 430 aa  276  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  39.11 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  39.11 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  39.11 
 
 		 441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 441 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  39.34 
 
 		 436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  39.48 
 
 		 431 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  38.64 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  39.3 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  39.3 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  38.64 
 
 		 442 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  38.64 
 
 		 442 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  38.64 
 
 		 442 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 		 441 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  38.64 
 
 		 442 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  38.64 
 
 		 442 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  38.64 
 
 		 442 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  39.72 
 
 		 441 aa  266  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 		 441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 444 aa  255  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  36.74 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 		 442 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  40.34 
 
 		 441 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  38.76 
 
 		 466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 396 aa  156  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 394 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 374 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 381 aa  127  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 378 aa  126  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 397 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 389 aa  126  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.1 
 
 		 384 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  29.21 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 387 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 382 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.66 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.45 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5602  AgaE protein, conversion of agropinic acid to mannopinic acid  45.16 
 
 		 134 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592638  hitchhiker  0.00552874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 394 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 819 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 376 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  26.05 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  26.82 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  26.82 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>