More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6338 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 446 aa  909    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  52.7 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  51.68 
 
 		 443 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  47.63 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  48.31 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  51.47 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  45.96 
 
 		 433 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 		 430 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  43.78 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 		 442 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  44.6 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  42.47 
 
 		 460 aa  339  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  41.24 
 
 		 430 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  43.96 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  47.1 
 
 		 447 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 		 447 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  45.71 
 
 		 447 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 		 430 aa  322  8e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 		 441 aa  315  9e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  40.05 
 
 		 445 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  39.28 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  42.53 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  41.47 
 
 		 441 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 		 439 aa  296  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  41.99 
 
 		 441 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  41.99 
 
 		 441 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 		 443 aa  294  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  38.72 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  41.99 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  40.94 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 441 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 442 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 441 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 441 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  41.06 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  41.45 
 
 		 441 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  40.65 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 446 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 		 471 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  35.02 
 
 		 446 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 442 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  33.41 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  33.41 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  33.41 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  33.41 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  32.24 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 		 455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 374 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 387 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 382 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 390 aa  136  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  28.13 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 390 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 388 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 		 385 aa  123  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 496 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 393 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  26.68 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4046  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.99 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>