More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5300 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  76.42 
 
 		 441 aa  670    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  67.12 
 
 		 441 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  72.79 
 
 		 441 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 441 aa  881    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  72.56 
 
 		 439 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  85.49 
 
 		 441 aa  734    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  73.76 
 
 		 442 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  73.7 
 
 		 466 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  73.02 
 
 		 441 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  90.48 
 
 		 441 aa  771    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  71.88 
 
 		 441 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  71.88 
 
 		 441 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  71.88 
 
 		 441 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  71.43 
 
 		 441 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  71.01 
 
 		 445 aa  624  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  71.88 
 
 		 441 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  73.92 
 
 		 441 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  72.34 
 
 		 441 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  62.36 
 
 		 441 aa  567  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  48.03 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  50.12 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  46.87 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  47.12 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  44.88 
 
 		 442 aa  358  8e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 443 aa  315  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  39.21 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  39.44 
 
 		 442 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  41.3 
 
 		 443 aa  302  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 		 433 aa  300  5e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  40.88 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  41.22 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 451 aa  276  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  39.11 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 447 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 430 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 		 430 aa  253  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  37.32 
 
 		 431 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  33.48 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  34.52 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  34.52 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  34.52 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  34.52 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 		 446 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 		 455 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  33.49 
 
 		 436 aa  209  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 		 444 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 471 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 396 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 390 aa  140  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.25 
 
 		 386 aa  133  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  29.05 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 816 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 381 aa  126  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 394 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 816 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  27.59 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.36 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.3 
 
 		 361 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 388 aa  116  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  27.51 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 395 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  23.52 
 
 		 394 aa  109  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 		 492 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>