More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  92.18 
 
 		 371 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  732    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  69.04 
 
 		 375 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  70.52 
 
 		 375 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  68.77 
 
 		 375 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  69.42 
 
 		 375 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  68.77 
 
 		 375 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  68.49 
 
 		 375 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  68.87 
 
 		 375 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  68.58 
 
 		 377 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  66.39 
 
 		 368 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  68.31 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  68.31 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  68.58 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  67.3 
 
 		 380 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  67.3 
 
 		 380 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0882  oxidoreductase, FAD-binding family protein  66.94 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  59.83 
 
 		 374 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  55.31 
 
 		 379 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  55.11 
 
 		 375 aa  345  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  49.71 
 
 		 370 aa  335  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  52.2 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0875  putative oxidoreductase  52.75 
 
 		 376 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960065  normal  0.263987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 398 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  35.1 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  33.61 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.99 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  32.13 
 
 		 382 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.74 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  30.59 
 
 		 375 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  26.65 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 441 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  24.38 
 
 		 391 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  24.38 
 
 		 391 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  24.59 
 
 		 391 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  30.81 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  24.59 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  24.59 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  24.59 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.77 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  28.65 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 441 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  30.42 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  24.05 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 441 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  23.71 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  29.45 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  25 
 
 		 330 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 466 aa  99.8  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 441 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.99 
 
 		 417 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 984 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 960 aa  97.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 441 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  28.46 
 
 		 368 aa  96.3  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 983 aa  95.9  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  31.3 
 
 		 385 aa  95.9  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  27.21 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  29.71 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 416 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.72 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.9 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  31.35 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  23.93 
 
 		 460 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  30.15 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.75 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  32.21 
 
 		 398 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  30.07 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  31.01 
 
 		 392 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  30.9 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  29.09 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28.64 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 374 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  28.99 
 
 		 372 aa  93.2  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 383 aa  92.8  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  30.77 
 
 		 372 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>