More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01436 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  100 
 
 		 378 aa  743    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  53.66 
 
 		 375 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  53.66 
 
 		 375 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  54.12 
 
 		 375 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  52.99 
 
 		 375 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  53.04 
 
 		 371 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  53.85 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  52.72 
 
 		 375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  53.68 
 
 		 375 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  51.51 
 
 		 374 aa  329  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.75 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  52.2 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  51.11 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  54.95 
 
 		 377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  54.67 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  54.67 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  50.8 
 
 		 379 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.95 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.95 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  45.24 
 
 		 370 aa  299  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  50.95 
 
 		 375 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0882  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.78 
 
 		 383 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0875  putative oxidoreductase  50.72 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960065  normal  0.263987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.68 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  32.03 
 
 		 379 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  27.2 
 
 		 391 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  28.04 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  26.93 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  26.93 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  26.67 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  26.67 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  26.67 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  27 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.07 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  28.42 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  27.7 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  31.43 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  29.37 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.42 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.98 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  31.69 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  31.69 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  30.39 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.1 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.19 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  30.25 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.71 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  27.79 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1933  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  31.9 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1670  hypothetical protein  31.9 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0305  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  31.9 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1236  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  31.9 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0948  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  31.9 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2211  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  31.9 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  26.72 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  31.54 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  25.61 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0215  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  31.6 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.08 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.2 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  27.54 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.95 
 
 		 416 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  29.49 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 378 aa  90.1  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 365 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 365 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3716  D-amino-acid dehydrogenase  27.71 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  29.38 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  31.63 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 439 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  22.62 
 
 		 369 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  22.62 
 
 		 369 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2074  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29 
 
 		 422 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  22.62 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  22.89 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  21.95 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  32.81 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  21.95 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.04 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  29.69 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.72 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0700  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.89 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>