More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4561 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 375 aa  743    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0875  putative oxidoreductase  87.73 
 
 		 376 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960065  normal  0.263987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  77.75 
 
 		 379 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  58.31 
 
 		 375 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  58.31 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  58.86 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  58.86 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  58.31 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  58.04 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  59.4 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  56.99 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  56.45 
 
 		 371 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  57.26 
 
 		 377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  53.37 
 
 		 368 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  56.99 
 
 		 377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  56.99 
 
 		 377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  56.71 
 
 		 377 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  50.14 
 
 		 374 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  56.52 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  56.52 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  46.22 
 
 		 370 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0882  oxidoreductase, FAD-binding family protein  56.06 
 
 		 383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  50.95 
 
 		 378 aa  311  9e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 393 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  26.15 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  25.9 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  25.9 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 393 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 391 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.06 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  25.9 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  25.9 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  25.9 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  25.64 
 
 		 391 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  25.6 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  31.77 
 
 		 379 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.63 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  25.21 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.1 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  31.55 
 
 		 392 aa  99.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 390 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  26.46 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 393 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.63 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 386 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  27.97 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.87 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.55 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28.09 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  28.84 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.86 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.52 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  26.09 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  25.59 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.77 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.52 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  25.94 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  25.52 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  25.17 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.89 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.18 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.48 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.48 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.54 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  24.87 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  27.3 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.13 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  29.17 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  28.15 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  27.93 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  25.2 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  24.89 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  28.5 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  26.56 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>