More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1727 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  88.1 
 
 
420 aa  740    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  100 
 
 
420 aa  847    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  56.97 
 
 
435 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  53.04 
 
 
413 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  47.84 
 
 
428 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  50.62 
 
 
406 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  43.66 
 
 
416 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 
416 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  41.42 
 
 
422 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 
413 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  35.66 
 
 
424 aa  278  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 
420 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  35.51 
 
 
416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  37.66 
 
 
416 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  36.64 
 
 
423 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
427 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 
427 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  35.78 
 
 
422 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 
431 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  36.73 
 
 
446 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
432 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 
420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
425 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  38.72 
 
 
428 aa  249  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 
434 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  32.37 
 
 
427 aa  239  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  35.71 
 
 
434 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 
414 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 
409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
424 aa  236  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.45 
 
 
421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  35.8 
 
 
432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 
410 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  35.19 
 
 
438 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 
409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 
427 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  36.28 
 
 
426 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  35.61 
 
 
415 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 
430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  35.18 
 
 
413 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 
423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 
415 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  33.9 
 
 
409 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  33.9 
 
 
409 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  32.92 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  33.41 
 
 
415 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  34.67 
 
 
413 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  32.78 
 
 
418 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  33.89 
 
 
405 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  32.13 
 
 
435 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 
419 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  32.78 
 
 
420 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  30.99 
 
 
433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  32.04 
 
 
415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
411 aa  200  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 
417 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
412 aa  196  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  30.94 
 
 
417 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
415 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  30.41 
 
 
418 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  30.22 
 
 
417 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
415 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
423 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
417 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 
416 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
411 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
411 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
421 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.55 
 
 
433 aa  180  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
416 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
416 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  29.88 
 
 
416 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
415 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
416 aa  173  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.9 
 
 
415 aa  173  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
414 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.1 
 
 
416 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  26.86 
 
 
462 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.86 
 
 
416 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
414 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 
413 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
441 aa  169  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
414 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
414 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  29.4 
 
 
416 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
415 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  29.78 
 
 
410 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  31.12 
 
 
414 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
410 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 
417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  29.15 
 
 
415 aa  164  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  29.17 
 
 
416 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
415 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  31.82 
 
 
413 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>