More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0900 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 417 aa  872    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  62.95 
 
 		 415 aa  588  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  62.95 
 
 		 415 aa  590  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  63.96 
 
 		 421 aa  586  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1724  FAD dependent oxidoreductase  42.75 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  44.2 
 
 		 410 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  41.01 
 
 		 414 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  41.55 
 
 		 416 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  41.55 
 
 		 416 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  40.58 
 
 		 410 aa  345  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 414 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 416 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  41.61 
 
 		 417 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  41.61 
 
 		 417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  40.87 
 
 		 415 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 417 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  41.73 
 
 		 414 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 414 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 414 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  39.61 
 
 		 417 aa  329  4e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 		 416 aa  329  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 		 417 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 414 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  40.1 
 
 		 433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  40.53 
 
 		 416 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  40.53 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 414 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  39.86 
 
 		 418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  39.04 
 
 		 415 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3940  D-amino-acid dehydrogenase  39.52 
 
 		 414 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401149  hitchhiker  0.00412438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 414 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  39.52 
 
 		 414 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  39.52 
 
 		 414 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 		 415 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  39.28 
 
 		 414 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  38.8 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  39.56 
 
 		 416 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 		 413 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  38.65 
 
 		 413 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  39.13 
 
 		 413 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  39.56 
 
 		 416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 		 413 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  39.37 
 
 		 413 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  39.37 
 
 		 413 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 413 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0629  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4795  putative D-amino-acid dehydrogenase  39.35 
 
 		 412 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  36.96 
 
 		 435 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0770  FAD-dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 507 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2137  D-amino-acid dehydrogenase  37.44 
 
 		 483 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0860  FAD-dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 414 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4628  D-amino-acid dehydrogenase  37.71 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.732848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3891  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 410 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  31.65 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2064  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 		 414 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  32.54 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 425 aa  186  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.4 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  30 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  28.47 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 410 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  28.74 
 
 		 415 aa  166  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 416 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 423 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 425 aa  161  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  27.21 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 413 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  26.51 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  27.25 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  28.14 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.54 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  30.35 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  23.41 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  23.41 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  26.82 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  27.63 
 
 		 434 aa  143  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  26.37 
 
 		 428 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  25.79 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.76 
 
 		 428 aa  139  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  27.04 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  25.37 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  23.37 
 
 		 416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 434 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>