More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4074 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 419 aa  855    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  51.55 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  48.19 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  49.52 
 
 		 426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  39.9 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  42.62 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  41.39 
 
 		 432 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  40.57 
 
 		 434 aa  310  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  41.01 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.31 
 
 		 421 aa  262  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  34.7 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  36.6 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  34.69 
 
 		 415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 427 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 427 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  33.49 
 
 		 423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 416 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  30.86 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  32.22 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  30.12 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  32.68 
 
 		 420 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  33.08 
 
 		 413 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  33.33 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  31.11 
 
 		 420 aa  183  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  32.94 
 
 		 413 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  32.35 
 
 		 420 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 435 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 410 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.84 
 
 		 428 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  31.4 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  31.4 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.88 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  33.61 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  31.08 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 		 434 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  28.64 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  28.4 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  29.48 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 417 aa  152  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 413 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  26.37 
 
 		 422 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 430 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  28.84 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  28.84 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  29.98 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  30.02 
 
 		 418 aa  146  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  28.1 
 
 		 418 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3940  D-amino-acid dehydrogenase  28.87 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401149  hitchhiker  0.00412438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 432 aa  143  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  25.99 
 
 		 416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0244  D-amino-acid dehydrogenase  29.64 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.227624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  26.86 
 
 		 417 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  27.59 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.2 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 415 aa  133  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  28.88 
 
 		 416 aa  133  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  28.88 
 
 		 416 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  25.72 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  29.33 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3891  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.78 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  25.34 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  28.03 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>