More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1416 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 424 aa  861    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  51.95 
 
 		 416 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  44.39 
 
 		 422 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  39.23 
 
 		 413 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.56 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  35.75 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  37.59 
 
 		 423 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  35.5 
 
 		 420 aa  276  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 		 416 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  36.63 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  34.96 
 
 		 416 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 431 aa  269  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  39.6 
 
 		 406 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 413 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 		 420 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 		 416 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 		 430 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.11 
 
 		 421 aa  249  9e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  36.53 
 
 		 434 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 427 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  34.19 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 410 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  34.22 
 
 		 422 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 432 aa  235  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 415 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  34.34 
 
 		 428 aa  233  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 425 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  32.37 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 420 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 		 415 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  32.56 
 
 		 427 aa  226  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  36.36 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  35.25 
 
 		 432 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 		 426 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 411 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  34.2 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 412 aa  213  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  34.55 
 
 		 438 aa  210  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  32.36 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  32.45 
 
 		 415 aa  207  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 430 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 419 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  33.74 
 
 		 413 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  33.58 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  33.58 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  33.5 
 
 		 413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  29.35 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  31.54 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 423 aa  183  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.98 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 415 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  28.4 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.33 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  29.57 
 
 		 416 aa  159  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 417 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.43 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  26.94 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  26.46 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.64 
 
 		 432 aa  153  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 414 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 421 aa  152  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  27.63 
 
 		 462 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.64 
 
 		 432 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 428 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.54 
 
 		 416 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  26.94 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  27.45 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.06 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.27 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>