More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2316 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  100 
 
 		 413 aa  818    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  99.03 
 
 		 413 aa  810    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  87.65 
 
 		 414 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 		 409 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  42.31 
 
 		 409 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  42.31 
 
 		 409 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  42.16 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  38.63 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 420 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  40.45 
 
 		 434 aa  263  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 415 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 431 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 415 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  41.31 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 		 415 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 416 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  36.9 
 
 		 420 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  37.32 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  34.21 
 
 		 416 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.44 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  36.46 
 
 		 440 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  34.04 
 
 		 446 aa  219  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  36.06 
 
 		 428 aa  219  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  32.52 
 
 		 405 aa  217  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 435 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 		 426 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 		 412 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  39.44 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  34.31 
 
 		 415 aa  212  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 416 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  34.69 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  34.67 
 
 		 420 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 420 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  36.01 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  35.61 
 
 		 423 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  32.28 
 
 		 427 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  37.92 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 		 423 aa  206  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 430 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 416 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 		 425 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  38.52 
 
 		 432 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  33.5 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  29.32 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  33.89 
 
 		 415 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  32.91 
 
 		 420 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  36.52 
 
 		 406 aa  193  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  33.66 
 
 		 433 aa  192  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 413 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  33.41 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  32.61 
 
 		 418 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  30.1 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  30.94 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.4 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  30.1 
 
 		 416 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  31.6 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 411 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 414 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 416 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  33.25 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3940  D-amino-acid dehydrogenase  33.33 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401149  hitchhiker  0.00412438 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  32.69 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  32.69 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.81 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 413 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 414 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 415 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  30.99 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0629  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 414 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 410 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 446 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 416 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  32.05 
 
 		 410 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  30.55 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1724  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  32.78 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>