More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0342 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 417 aa  853    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  65.23 
 
 		 415 aa  580  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  63.61 
 
 		 415 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  63.86 
 
 		 415 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  57.59 
 
 		 416 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  57.59 
 
 		 416 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  57.45 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  57.11 
 
 		 410 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  57.35 
 
 		 410 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  56.63 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  52.77 
 
 		 417 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  54.46 
 
 		 417 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  51.81 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  52.4 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  52.16 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1724  FAD dependent oxidoreductase  53.37 
 
 		 414 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  53.61 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  51.81 
 
 		 413 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  51.81 
 
 		 413 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  52.16 
 
 		 418 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  52.05 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  51.32 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0770  FAD-dependent oxidoreductase  53.85 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2137  D-amino-acid dehydrogenase  53.85 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0629  FAD dependent oxidoreductase  52.53 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  51.69 
 
 		 446 aa  408  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  51.69 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  52.53 
 
 		 413 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  52.53 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0860  FAD-dependent oxidoreductase  53.85 
 
 		 414 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  52.53 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  52.53 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  51.92 
 
 		 414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3940  D-amino-acid dehydrogenase  50.48 
 
 		 414 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401149  hitchhiker  0.00412438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  50.12 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  47.84 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  47.6 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 		 414 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  50.48 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  50.12 
 
 		 414 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  50.48 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  47.36 
 
 		 414 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  47.47 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  48.56 
 
 		 414 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 414 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  46.99 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4795  putative D-amino-acid dehydrogenase  46.62 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 421 aa  354  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  40.57 
 
 		 415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 		 417 aa  330  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3891  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 		 410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  40.81 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4628  D-amino-acid dehydrogenase  37.53 
 
 		 412 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.732848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2064  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 		 414 aa  266  5.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  36.61 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 420 aa  193  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  31.96 
 
 		 415 aa  192  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 432 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  30.09 
 
 		 446 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  30.68 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  31.82 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  30.54 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.14 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.98 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  29.64 
 
 		 415 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  30.53 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  30.05 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  28.54 
 
 		 416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  26.55 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 410 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 411 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  27.29 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  26.99 
 
 		 462 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  29.02 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  25.42 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  28.5 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  29.5 
 
 		 409 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 411 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  29.5 
 
 		 409 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 416 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>