More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5033 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  99.76 
 
 		 413 aa  815    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0629  FAD dependent oxidoreductase  96.61 
 
 		 440 aa  781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  94.19 
 
 		 413 aa  780    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 413 aa  819    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  94.43 
 
 		 413 aa  785    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 413 aa  819    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  92.25 
 
 		 413 aa  749    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  76.76 
 
 		 435 aa  624  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0860  FAD-dependent oxidoreductase  76.51 
 
 		 414 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0770  FAD-dependent oxidoreductase  76.51 
 
 		 507 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2137  D-amino-acid dehydrogenase  76.51 
 
 		 483 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  69.25 
 
 		 413 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  68.84 
 
 		 414 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  66.18 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3940  D-amino-acid dehydrogenase  66.18 
 
 		 414 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401149  hitchhiker  0.00412438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  65.94 
 
 		 414 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  65.94 
 
 		 414 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  65.7 
 
 		 414 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  65.94 
 
 		 414 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  65.22 
 
 		 414 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  57.59 
 
 		 414 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  57.25 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  56.87 
 
 		 414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  56.87 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  55.21 
 
 		 410 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  53.75 
 
 		 415 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  55.23 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  55.23 
 
 		 417 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  54.13 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  54.99 
 
 		 416 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  54.24 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  52.54 
 
 		 415 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  52.3 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  53.51 
 
 		 417 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  52.53 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  54.72 
 
 		 416 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  53.4 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  53.28 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  52.54 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  52.54 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  53.04 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  54.24 
 
 		 410 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  50.36 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  53.27 
 
 		 414 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  50.12 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  50.12 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1724  FAD dependent oxidoreductase  50.85 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4795  putative D-amino-acid dehydrogenase  45.71 
 
 		 412 aa  332  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 		 415 aa  319  5e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 417 aa  316  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  38.16 
 
 		 415 aa  315  8e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 		 421 aa  306  6e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3891  FAD dependent oxidoreductase  39.8 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4628  D-amino-acid dehydrogenase  42.58 
 
 		 412 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.732848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  41.73 
 
 		 418 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2064  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 414 aa  240  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 425 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  33.33 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  33.57 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 425 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 413 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 420 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  30.28 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  30.43 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 		 427 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.84 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 434 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 409 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  30.35 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  32.23 
 
 		 435 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  32.05 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  31.28 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  30.48 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.58 
 
 		 421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 410 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 411 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  28.91 
 
 		 422 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  30.68 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  31.03 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  33.26 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  33.26 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  26.47 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 415 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  30.79 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>