More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3847 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 411 aa  836    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  88.56 
 
 		 411 aa  758    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  65.94 
 
 		 411 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  37.16 
 
 		 423 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 427 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 427 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 420 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 431 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.82 
 
 		 421 aa  221  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  34.49 
 
 		 409 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  30.92 
 
 		 427 aa  219  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  34.96 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  34.24 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  34.24 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 		 422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  31.57 
 
 		 424 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  27.96 
 
 		 446 aa  206  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  30.9 
 
 		 428 aa  202  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  29.51 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  28.57 
 
 		 405 aa  196  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 426 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 414 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 432 aa  193  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  31.22 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  30.61 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  31.95 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  32.05 
 
 		 435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  29.15 
 
 		 415 aa  182  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  30.61 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  32.15 
 
 		 420 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  26.89 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  30.1 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 415 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 430 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  29.08 
 
 		 420 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  31.81 
 
 		 432 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.83 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  29.28 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.94 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 417 aa  169  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  28.47 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.08 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  32.03 
 
 		 406 aa  166  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  32.62 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  30.54 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  25.28 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  28.05 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  28.89 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  30.17 
 
 		 438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  26.6 
 
 		 417 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 414 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  28.47 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.12 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 414 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  26.09 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 414 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 427 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 418 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 417 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  25.85 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  26.23 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  25.3 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 441 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>