More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2797 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 419 aa  831    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  69.17 
 
 		 416 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  67.39 
 
 		 415 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  66.67 
 
 		 420 aa  558  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3596  FAD dependent oxidoreductase  62.08 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5323  D-amino-acid dehydrogenase  59.95 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.161486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5235  D-amino-acid dehydrogenase  59.95 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288943  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5615  D-amino-acid dehydrogenase  59.71 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.925695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  60.86 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  56.69 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  54.88 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1087  FAD dependent oxidoreductase  52.93 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  49.07 
 
 		 452 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  49.28 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0955  D-amino-acid dehydrogenase  49.52 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 482 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  48.77 
 
 		 408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 441 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.06 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  28.14 
 
 		 462 aa  176  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  31.94 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  32.86 
 
 		 415 aa  169  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.14 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  32.48 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  30.48 
 
 		 421 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  30.05 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.57 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 411 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.54 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  31.7 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.31 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.06 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.32 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.06 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  30.37 
 
 		 439 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.82 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0090  D-amino-acid dehydrogenase  31.66 
 
 		 446 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.06 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.9 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0071  D-amino-acid dehydrogenase  31.66 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.83 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.56 
 
 		 432 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.29 
 
 		 432 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4507  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.81 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1094  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.02 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  32.34 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.45 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.75 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.385338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 415 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.47 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  29.46 
 
 		 419 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.72 
 
 		 432 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0131  D-amino-acid dehydrogenase  30.39 
 
 		 444 aa  145  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.814059  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.78 
 
 		 421 aa  145  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.17 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.81 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2000  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.5 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.881788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.72 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.85 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3886  D-amino-acid dehydrogenase  29.79 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.72 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.72 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.72 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.72 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.72 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.72 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.72 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6239  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3159  D-amino-acid dehydrogenase  30.52 
 
 		 436 aa  143  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6408  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 414 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6641  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 414 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.6 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2122  D-amino-acid dehydrogenase  29.95 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17481  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.93 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0751  D-amino-acid dehydrogenase  29.63 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  27.43 
 
 		 446 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  27.9 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 420 aa  140  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 418 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.92 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3394  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.361362 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.65 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0528  D-amino-acid dehydrogenase  28.57 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0091768  hitchhiker  0.00000110387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  25.86 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  26.21 
 
 		 427 aa  136  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0148  D-amino-acid dehydrogenase  28.91 
 
 		 445 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.739629  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.78 
 
 		 433 aa  136  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5009  D-amino-acid dehydrogenase  28.67 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>