More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5199 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
440 aa  880    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  34.6 
 
 
462 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 
441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  41.97 
 
 
415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 
420 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 
415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 
418 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 
415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
437 aa  219  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  32.69 
 
 
416 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.94 
 
 
418 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.39 
 
 
432 aa  193  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.76 
 
 
416 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.75 
 
 
428 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  32.69 
 
 
423 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  32.23 
 
 
419 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  31.49 
 
 
434 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  30.9 
 
 
417 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.26 
 
 
419 aa  189  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  32.07 
 
 
433 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.33 
 
 
433 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
427 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  30.34 
 
 
415 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.3 
 
 
428 aa  187  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.71 
 
 
432 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.86 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.45 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.48 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  29.74 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.41 
 
 
433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
418 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03073  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.84 
 
 
428 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.88 
 
 
433 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.26 
 
 
416 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.31 
 
 
433 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.84 
 
 
432 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
431 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  31.89 
 
 
416 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.43 
 
 
432 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21848  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1941  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.43 
 
 
432 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377151  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.98 
 
 
428 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1945  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.43 
 
 
432 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.12 
 
 
417 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1330  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.43 
 
 
432 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000545747  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1515  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.43 
 
 
432 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.684243  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
419 aa  179  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0415  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.28 
 
 
421 aa  179  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000453609  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30 
 
 
434 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.9 
 
 
434 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.9 
 
 
434 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.33 
 
 
416 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2380  D-amino-acid dehydrogenase  29.95 
 
 
428 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.98 
 
 
428 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.98 
 
 
428 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.9 
 
 
434 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.5 
 
 
428 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30 
 
 
434 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.07 
 
 
416 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.47 
 
 
434 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 
417 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30 
 
 
434 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1960  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.71 
 
 
434 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00842903  normal  0.752905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1676  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.71 
 
 
434 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000458622  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01164  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.71 
 
 
432 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2459  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  28.71 
 
 
432 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2436  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.71 
 
 
432 aa  176  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0019507  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1292  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.71 
 
 
432 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000190637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1334  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.71 
 
 
432 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01174  hypothetical protein  28.71 
 
 
432 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.81 
 
 
434 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.78 
 
 
416 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 
416 aa  176  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1347  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.71 
 
 
432 aa  176  9e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.15982  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.24 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.74 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.36 
 
 
418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 
416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.83 
 
 
432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0528  D-amino-acid dehydrogenase  30.09 
 
 
443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0091768  hitchhiker  0.00000110387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  28.9 
 
 
439 aa  173  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.4 
 
 
416 aa  173  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0751  D-amino-acid dehydrogenase  29.76 
 
 
433 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.26 
 
 
429 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.835424 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.88 
 
 
421 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
416 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0090  D-amino-acid dehydrogenase  29.6 
 
 
446 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0740  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.25 
 
 
434 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.968608  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0071  D-amino-acid dehydrogenase  29.6 
 
 
454 aa  172  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.5 
 
 
428 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.5 
 
 
428 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.5 
 
 
428 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.5 
 
 
428 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0791  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.9 
 
 
417 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000194872 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.5 
 
 
428 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.5 
 
 
428 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.5 
 
 
428 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>