More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6265 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 413 aa  834    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  40.1 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  37.8 
 
 		 416 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  39.45 
 
 		 427 aa  279  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  38.69 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 427 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 427 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 431 aa  264  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  38.35 
 
 		 406 aa  262  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  38.16 
 
 		 420 aa  262  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  35.41 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  34.59 
 
 		 420 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  37.28 
 
 		 416 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  35.85 
 
 		 413 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.52 
 
 		 428 aa  250  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  34.67 
 
 		 424 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  33.81 
 
 		 446 aa  242  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 		 432 aa  242  9e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 		 423 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  34.4 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.74 
 
 		 421 aa  233  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  33.01 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 410 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  34.06 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  32.93 
 
 		 435 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 420 aa  223  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  32.62 
 
 		 422 aa  222  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 423 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 409 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  35.22 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  31.06 
 
 		 427 aa  209  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 411 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  31.55 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  34.52 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  34.52 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  34.12 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  33.57 
 
 		 432 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 416 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  31.31 
 
 		 417 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 416 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 416 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 415 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  30.58 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  31.94 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 414 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 414 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  28.71 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 419 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 430 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  31.23 
 
 		 433 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  30.4 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  28.86 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 415 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 415 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  29.47 
 
 		 418 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  32.94 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  30.42 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  32.85 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 441 aa  179  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  29.28 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.35 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 414 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  31.4 
 
 		 410 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 414 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  31.34 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  31.59 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  32.61 
 
 		 414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  33.25 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  33.25 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>