More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6619 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 410 aa  818    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  78.05 
 
 		 409 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  64.88 
 
 		 409 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  64.88 
 
 		 409 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  64.15 
 
 		 409 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  40.69 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 		 420 aa  289  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  39.53 
 
 		 413 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  39.28 
 
 		 413 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  38.39 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 		 414 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 431 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 427 aa  249  9e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 425 aa  245  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  35.24 
 
 		 446 aa  243  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 		 432 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  37.8 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  35.02 
 
 		 435 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  34.31 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 435 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 424 aa  232  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  35.34 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  35.55 
 
 		 420 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 416 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 415 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  32.24 
 
 		 420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  36.93 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  35.61 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.6 
 
 		 421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 415 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  34.83 
 
 		 422 aa  220  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  32.75 
 
 		 420 aa  220  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  35.7 
 
 		 434 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  37.37 
 
 		 440 aa  219  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  32.03 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.59 
 
 		 428 aa  216  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 416 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  31.77 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  35.32 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.64 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  31.22 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 430 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 411 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  30.25 
 
 		 416 aa  199  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 423 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  33.01 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 		 422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 		 427 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  30.83 
 
 		 418 aa  193  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  33.42 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 419 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 430 aa  179  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  31.33 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 417 aa  176  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  30.9 
 
 		 416 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 441 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  30.51 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.19 
 
 		 415 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 418 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  28.16 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  27.91 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  26.17 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 414 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  30.81 
 
 		 413 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  28.91 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 440 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  30.86 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  30.86 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 413 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 420 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 417 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.15 
 
 		 428 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>