More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6396 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 424 aa  858    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  63.88 
 
 		 432 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  62.15 
 
 		 438 aa  511  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  54.27 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  54.44 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  47.96 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  51.2 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  39.9 
 
 		 419 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  40.09 
 
 		 421 aa  297  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  39.33 
 
 		 415 aa  292  9e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  38.31 
 
 		 415 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 427 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  38.04 
 
 		 423 aa  256  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 		 420 aa  240  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  35.47 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  32.78 
 
 		 416 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 432 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  34.51 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.48 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  34.09 
 
 		 420 aa  222  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  37.01 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  33.26 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  34.92 
 
 		 422 aa  216  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 416 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  35.25 
 
 		 409 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  35.25 
 
 		 409 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  33.95 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  34.05 
 
 		 413 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 425 aa  209  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  35.89 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  35.32 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  31.88 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  34.43 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  34.28 
 
 		 415 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  31.67 
 
 		 427 aa  199  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  34.49 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  33.9 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 422 aa  192  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  33.82 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  28.4 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  30.53 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  30.42 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 419 aa  162  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  27.86 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  29.59 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 414 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  28.85 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 413 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  28.61 
 
 		 417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  30.75 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  29.07 
 
 		 416 aa  147  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  28.84 
 
 		 416 aa  144  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.71 
 
 		 416 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0629  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 414 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  31.6 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  31.6 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.25 
 
 		 416 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0415  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.1 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000453609  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 414 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  29.62 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.09 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>