More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0507 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  100 
 
 		 423 aa  842    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  80.19 
 
 		 427 aa  682    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  80.38 
 
 		 427 aa  689    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  46.04 
 
 		 431 aa  345  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  47.36 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  42.09 
 
 		 423 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  41.97 
 
 		 421 aa  310  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 420 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 		 413 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 		 416 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  37.71 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  40.38 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  37.84 
 
 		 415 aa  266  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  37.18 
 
 		 427 aa  265  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  38.7 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  37.16 
 
 		 411 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 		 416 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  41.67 
 
 		 432 aa  262  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  41.99 
 
 		 422 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  39.16 
 
 		 411 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  37.5 
 
 		 424 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  36.66 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  35.9 
 
 		 405 aa  259  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  41.8 
 
 		 434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  39.52 
 
 		 428 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  40.53 
 
 		 420 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 432 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  35.84 
 
 		 416 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  37.16 
 
 		 411 aa  256  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 424 aa  256  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  42.27 
 
 		 415 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  37.88 
 
 		 440 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  37.02 
 
 		 409 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  35.78 
 
 		 420 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 415 aa  249  8e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  40.94 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  36.64 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  41.35 
 
 		 415 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 416 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  37.38 
 
 		 413 aa  239  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 427 aa  236  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 409 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  38.63 
 
 		 409 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  38.63 
 
 		 409 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 		 435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.85 
 
 		 428 aa  232  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 434 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  30.69 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 430 aa  219  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  36.84 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  34.06 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  33.33 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 416 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 416 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  35.73 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 		 416 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 417 aa  199  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  35.16 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  34.22 
 
 		 418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  34.46 
 
 		 433 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  31.08 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 414 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  33.09 
 
 		 410 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  36.54 
 
 		 414 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 440 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 415 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  32.37 
 
 		 413 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  33.89 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 413 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3940  D-amino-acid dehydrogenase  34.97 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401149  hitchhiker  0.00412438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 414 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 415 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.2 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  35.31 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  35.31 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2137  D-amino-acid dehydrogenase  34.13 
 
 		 483 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 413 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>