More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1533 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 428 aa  877    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  62.86 
 
 		 446 aa  531  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  60.05 
 
 		 420 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  59.67 
 
 		 432 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  58.98 
 
 		 422 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  43.97 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  43.91 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  43.78 
 
 		 415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 		 415 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  43.78 
 
 		 415 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  40.92 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  44.52 
 
 		 420 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  39.52 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  38.76 
 
 		 431 aa  269  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  38.63 
 
 		 427 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  38.63 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  36.75 
 
 		 416 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 		 416 aa  250  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 		 420 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  37.06 
 
 		 416 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  38.82 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  37.41 
 
 		 420 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 		 410 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 		 413 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  38.31 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 425 aa  236  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  33.81 
 
 		 415 aa  229  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 416 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  33.75 
 
 		 424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.59 
 
 		 428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 414 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  34.29 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  39.75 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  35.32 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 424 aa  222  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  36.17 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  35.66 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  36.17 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.05 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 412 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  35.41 
 
 		 413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  35.68 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 411 aa  213  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 411 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  34.18 
 
 		 438 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  34.43 
 
 		 432 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 434 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  31.97 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  31.9 
 
 		 435 aa  196  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  32.85 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 416 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 416 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 417 aa  192  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  31.71 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  31.33 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 417 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  30.92 
 
 		 410 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.82 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 410 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 414 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 414 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  32.52 
 
 		 420 aa  173  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 414 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  28.17 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  32.08 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 423 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  30.84 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 415 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.43 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  29.74 
 
 		 416 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  29.5 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>