More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2597 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 415 aa  826    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  76.4 
 
 		 416 aa  631  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  71.53 
 
 		 420 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  67.39 
 
 		 419 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3596  FAD dependent oxidoreductase  65.45 
 
 		 424 aa  528  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5615  D-amino-acid dehydrogenase  64.48 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.925695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5323  D-amino-acid dehydrogenase  64.48 
 
 		 417 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.161486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5235  D-amino-acid dehydrogenase  64.48 
 
 		 417 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288943  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  64.39 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  58.88 
 
 		 432 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  52.55 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0955  D-amino-acid dehydrogenase  49.62 
 
 		 416 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  47.79 
 
 		 452 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  49.52 
 
 		 458 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1087  FAD dependent oxidoreductase  49.4 
 
 		 425 aa  361  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  50.49 
 
 		 482 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  47.54 
 
 		 408 aa  340  2e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.41 
 
 		 428 aa  212  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  28.54 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  31.84 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 415 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.68 
 
 		 432 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.17 
 
 		 432 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.76 
 
 		 418 aa  169  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 418 aa  166  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.62 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.96 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.34 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0090  D-amino-acid dehydrogenase  30.95 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0071  D-amino-acid dehydrogenase  30.95 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  31.85 
 
 		 421 aa  161  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.88 
 
 		 428 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.92 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.88 
 
 		 428 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.88 
 
 		 428 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.88 
 
 		 428 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.88 
 
 		 428 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.91 
 
 		 433 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  32.54 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  28.29 
 
 		 417 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  32.27 
 
 		 428 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.2 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1941  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.85 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.71 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1515  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.85 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.684243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.71 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1330  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.74 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000545747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1945  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.74 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.290196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.85 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.41 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.97 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  29.48 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.97 
 
 		 434 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0131  D-amino-acid dehydrogenase  30.63 
 
 		 444 aa  156  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.814059  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.61 
 
 		 428 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.97 
 
 		 434 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.61 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.61 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.38 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.41 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.57 
 
 		 434 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  30.75 
 
 		 415 aa  154  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.37 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.78 
 
 		 434 aa  153  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.78 
 
 		 434 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.78 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.63 
 
 		 432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5009  D-amino-acid dehydrogenase  29.47 
 
 		 448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.6 
 
 		 416 aa  152  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.03 
 
 		 416 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.6 
 
 		 416 aa  152  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.15 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  30.71 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.24 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.56 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1813  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.69 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.37 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.38 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 411 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 440 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  27.3 
 
 		 418 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01164  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.17 
 
 		 432 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2459  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  29.17 
 
 		 432 aa  149  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1676  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.17 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000458622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2436  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.17 
 
 		 432 aa  149  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0019507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1292  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.17 
 
 		 432 aa  149  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000190637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01174  hypothetical protein  29.17 
 
 		 432 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1334  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.17 
 
 		 432 aa  149  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195044  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1960  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.17 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00842903  normal  0.752905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>