More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0955 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0955  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 416 aa  828    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  59.14 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  53.16 
 
 		 452 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  55.26 
 
 		 458 aa  421  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1087  FAD dependent oxidoreductase  56.09 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  54.72 
 
 		 482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  49.52 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  51.08 
 
 		 420 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  49.4 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  50.13 
 
 		 419 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5615  D-amino-acid dehydrogenase  49.51 
 
 		 417 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.925695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5235  D-amino-acid dehydrogenase  49.27 
 
 		 417 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5323  D-amino-acid dehydrogenase  49.27 
 
 		 417 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.161486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3596  FAD dependent oxidoreductase  48.54 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  47.8 
 
 		 432 aa  345  6e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.07 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  35.35 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  26.71 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.67 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  34.49 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.24 
 
 		 432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.24 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  31.59 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.75 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.25 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.25 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.3 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.25 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.39 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.46 
 
 		 433 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  29.16 
 
 		 415 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.48 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.47 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.5 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.2 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.07 
 
 		 432 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.83 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 418 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 440 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  32.32 
 
 		 435 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 441 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 410 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  31.36 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  30.58 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.76 
 
 		 434 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.36 
 
 		 418 aa  146  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30 
 
 		 416 aa  146  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0069  D-amino-acid dehydrogenase  31.13 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.88 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.88 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.88 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.88 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.57 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.88 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.88 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  28.68 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 416 aa  144  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 416 aa  144  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 427 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.77 
 
 		 421 aa  143  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.98 
 
 		 418 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.64 
 
 		 428 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.64 
 
 		 428 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.16 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  27.14 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.16 
 
 		 428 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 413 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.16 
 
 		 428 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.92 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.64 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  32.3 
 
 		 423 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  30.37 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03073  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.33 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 410 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0751  D-amino-acid dehydrogenase  28.85 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  30.9 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  29.43 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  32.12 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2102  D-amino-acid dehydrogenase  32.23 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0740  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.98 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.968608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.76 
 
 		 416 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.26 
 
 		 425 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2459  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  28.12 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2436  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.12 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0019507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>