More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1477 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 420 aa  863    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  47.92 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  44.91 
 
 		 415 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  41.78 
 
 		 462 aa  362  9e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  43.45 
 
 		 441 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  40.63 
 
 		 415 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 437 aa  227  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 420 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  32.2 
 
 		 416 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  31.32 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.96 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  29.67 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 427 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  32.04 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  29.06 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.34 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  31.38 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4229  D-amino-acid dehydrogenase  29.4 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.825619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 420 aa  182  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  30.14 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  29.38 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.21 
 
 		 418 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.14 
 
 		 418 aa  176  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0415  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.73 
 
 		 421 aa  176  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000453609  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  29.86 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  31.41 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  30.64 
 
 		 419 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 418 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.16 
 
 		 421 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  28.02 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  30.66 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.5 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.54 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.78 
 
 		 418 aa  170  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.72 
 
 		 432 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1385  D-amino-acid dehydrogenase  27.9 
 
 		 401 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 416 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  27.45 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.76 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0751  D-amino-acid dehydrogenase  28.91 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.1 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3886  D-amino-acid dehydrogenase  29.18 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3159  D-amino-acid dehydrogenase  29.18 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.91 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  29.37 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 424 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  27.94 
 
 		 417 aa  167  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.68 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.08 
 
 		 421 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  31.03 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5290  D-amino-acid dehydrogenase  30.02 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.73 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  30.17 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.8 
 
 		 420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0244  D-amino-acid dehydrogenase  28.88 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.227624 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.38 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.49 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 409 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0094  D-amino-acid dehydrogenase  27.35 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  27.45 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  28.64 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.87 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.93 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1094  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.87 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0886  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.93 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.08 
 
 		 416 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.6 
 
 		 417 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 416 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.93 
 
 		 434 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.93 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2122  D-amino-acid dehydrogenase  29.06 
 
 		 421 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17481  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2380  D-amino-acid dehydrogenase  28.57 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  27.14 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  27.66 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.6 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.86 
 
 		 434 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  26.71 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4473  D-amino-acid dehydrogenase  28.33 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.16 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.9 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0528  D-amino-acid dehydrogenase  29.5 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0091768  hitchhiker  0.00000110387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  26.65 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3716  D-amino-acid dehydrogenase  28.05 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.57 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>