More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0827 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 419 aa  811    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  66.75 
 
 		 420 aa  531  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  63.7 
 
 		 416 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  63.92 
 
 		 415 aa  510  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  60.44 
 
 		 419 aa  494  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3596  FAD dependent oxidoreductase  58.5 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5615  D-amino-acid dehydrogenase  58.7 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.925695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5323  D-amino-acid dehydrogenase  58.6 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.161486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5235  D-amino-acid dehydrogenase  58.6 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  56.23 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  54.03 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  51.17 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  52.09 
 
 		 482 aa  358  9e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0955  D-amino-acid dehydrogenase  50.25 
 
 		 416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  51.31 
 
 		 458 aa  354  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1087  FAD dependent oxidoreductase  49.52 
 
 		 425 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  46.1 
 
 		 408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.82 
 
 		 428 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 418 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 420 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  32.11 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.38 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.66 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.38 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.38 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.81 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  26.62 
 
 		 462 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  32.43 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.81 
 
 		 432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  29.25 
 
 		 417 aa  153  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.88 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.65 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.61 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 437 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.7 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.77 
 
 		 441 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  30.4 
 
 		 415 aa  147  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2000  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.18 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.881788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.64 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 440 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.41 
 
 		 435 aa  143  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.385338  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3886  D-amino-acid dehydrogenase  30.77 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3159  D-amino-acid dehydrogenase  30.77 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  34.31 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  30.88 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0069  D-amino-acid dehydrogenase  31.9 
 
 		 411 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  30.66 
 
 		 421 aa  140  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  30.77 
 
 		 419 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  27.51 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.12 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.08 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.83 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  29.32 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.84 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.74 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0528  D-amino-acid dehydrogenase  28.37 
 
 		 443 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0091768  hitchhiker  0.00000110387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.68 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  29.27 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.13 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.05 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  32 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.81 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.1 
 
 		 419 aa  129  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 427 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.81 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.81 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.81 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.81 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.81 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.81 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.83 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03073  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.89 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  29.13 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  31.62 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0131  D-amino-acid dehydrogenase  29.41 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.814059  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.47 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.22 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  27.68 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2122  D-amino-acid dehydrogenase  31.04 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17481  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  30.17 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 431 aa  126  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  29.15 
 
 		 440 aa  126  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1330  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.17 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000545747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  32.05 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1941  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.78 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.78 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  29.26 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>