More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1706 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  78.91 
 
 		 422 aa  692    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 420 aa  866    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  70.71 
 
 		 432 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  62.8 
 
 		 446 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  60.05 
 
 		 428 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  44.21 
 
 		 427 aa  355  5.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  42.41 
 
 		 405 aa  316  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  41.19 
 
 		 440 aa  302  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  42.32 
 
 		 415 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  42.57 
 
 		 415 aa  300  4e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  41.47 
 
 		 415 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  42.69 
 
 		 420 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 415 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  36.79 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  40 
 
 		 423 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 431 aa  270  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  38.7 
 
 		 425 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 		 416 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 427 aa  259  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  37.26 
 
 		 427 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 420 aa  252  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  35.48 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  34.58 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  35.59 
 
 		 416 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.84 
 
 		 428 aa  245  9e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  36.84 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  35.82 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  35.1 
 
 		 415 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 		 424 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 		 409 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  34.08 
 
 		 420 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 411 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 412 aa  226  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 413 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 435 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  35.55 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.82 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 409 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  33.66 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  33.73 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  33.33 
 
 		 409 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  33.33 
 
 		 409 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  36.19 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 411 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  35.56 
 
 		 432 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 414 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 416 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  33.65 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 416 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  31.76 
 
 		 418 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  33.64 
 
 		 438 aa  206  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  35.14 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  34.89 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  31.72 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  31.22 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  31.07 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.06 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 430 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 415 aa  183  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 417 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  29.83 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  30.42 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  27.49 
 
 		 462 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  30.9 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  29.49 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 413 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 414 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0629  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  30.59 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  30.59 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 413 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 414 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 416 aa  166  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 415 aa  166  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  29.36 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>