More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01910 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  100 
 
 		 416 aa  840    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  38.99 
 
 		 415 aa  292  8e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  30.8 
 
 		 462 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 415 aa  219  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 420 aa  206  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.43 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.6 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  31.4 
 
 		 434 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.61 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 418 aa  196  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.07 
 
 		 418 aa  192  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  30.22 
 
 		 421 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 415 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.6 
 
 		 433 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.35 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  32.75 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0528  D-amino-acid dehydrogenase  33.17 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0091768  hitchhiker  0.00000110387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.39 
 
 		 432 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.61 
 
 		 432 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33 
 
 		 432 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.58 
 
 		 421 aa  186  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.13 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.41 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.77 
 
 		 416 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  30.98 
 
 		 421 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0955  D-amino-acid dehydrogenase  34.81 
 
 		 416 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  31.94 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.81 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  29.66 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.9 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0926  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.86 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.531144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.44 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.65 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.19 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.19 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.19 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.19 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.19 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  33.57 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.67 
 
 		 432 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.29 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.95 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.95 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.67 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.45 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.92 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0415  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.26 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000453609  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.45 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  30.64 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.82 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3589  D-amino-acid dehydrogenase  30.98 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0959455  hitchhiker  0.00000935542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.64 
 
 		 429 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.55 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1094  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 421 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3159  D-amino-acid dehydrogenase  31.74 
 
 		 436 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3886  D-amino-acid dehydrogenase  31.5 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  30.84 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.71 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.31 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0740  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.26 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.968608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1817  D-amino-acid dehydrogenase  32.23 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.904553  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  32.09 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03073  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.17 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  28.78 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.55 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  29.2 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0796  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.16 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3394  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.361362 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.31 
 
 		 428 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.31 
 
 		 428 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.93 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2001  D-amino-acid dehydrogenase  32.28 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.64 
 
 		 416 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0069  D-amino-acid dehydrogenase  34.17 
 
 		 411 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.93 
 
 		 436 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.31 
 
 		 416 aa  170  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  31.07 
 
 		 417 aa  169  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.69 
 
 		 434 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.1 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.92 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3596  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 424 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0148  D-amino-acid dehydrogenase  30.21 
 
 		 445 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.739629  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  29.43 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1813  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0886  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.48 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  29.72 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>