More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2746 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  100 
 
 		 416 aa  862    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  49.39 
 
 		 430 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  36.6 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  35.75 
 
 		 427 aa  273  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  36.63 
 
 		 422 aa  269  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 420 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 415 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  37.11 
 
 		 420 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  35.68 
 
 		 440 aa  263  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 432 aa  260  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  37.83 
 
 		 428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  33.99 
 
 		 405 aa  256  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 427 aa  245  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 427 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  31.49 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  32.22 
 
 		 416 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 425 aa  230  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 416 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.37 
 
 		 421 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 409 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 416 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 410 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.3 
 
 		 428 aa  206  9e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  30.98 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  30.98 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  29.32 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  29.32 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  29.35 
 
 		 424 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 414 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  28.68 
 
 		 415 aa  189  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  32.93 
 
 		 413 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 435 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  28.5 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  32.84 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 416 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 416 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 414 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  30.13 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 424 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  29.13 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  27.82 
 
 		 420 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  29.12 
 
 		 418 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  27.03 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 414 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  26.28 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  28.91 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  26.76 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 416 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  27.05 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  28.64 
 
 		 414 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  28.64 
 
 		 414 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 415 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  28.06 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3940  D-amino-acid dehydrogenase  28.16 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401149  hitchhiker  0.00412438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  27.45 
 
 		 414 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 410 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  27.18 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  25.36 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  26.23 
 
 		 462 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 415 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  28.47 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  25 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  27.51 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  27.51 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  28.34 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 426 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>