More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2554 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 434 aa  851    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  60.94 
 
 		 432 aa  461  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  54.27 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  58.18 
 
 		 438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  54.21 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  48.61 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  52.47 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 		 419 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  43.82 
 
 		 420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  41.96 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.41 
 
 		 421 aa  269  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  41.31 
 
 		 423 aa  267  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  41.01 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  40.83 
 
 		 427 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  36.08 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  35.14 
 
 		 415 aa  239  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  35.14 
 
 		 415 aa  236  6e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  40.87 
 
 		 413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  40.87 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  35.58 
 
 		 424 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  35.48 
 
 		 420 aa  231  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  34.81 
 
 		 416 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  36.97 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 		 416 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 409 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  40.48 
 
 		 406 aa  222  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 412 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 420 aa  219  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  34.67 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  35.83 
 
 		 423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 		 416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  32.49 
 
 		 446 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 416 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 422 aa  210  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  35.68 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  37.99 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  30.4 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 415 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 415 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  31.47 
 
 		 427 aa  196  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  36.32 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  36.32 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.41 
 
 		 428 aa  189  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  35.35 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  35.25 
 
 		 420 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 		 430 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 411 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  33.26 
 
 		 433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 411 aa  166  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  31.21 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  31.62 
 
 		 417 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 415 aa  163  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  30 
 
 		 417 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  31.41 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  27.74 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 414 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 414 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  30.82 
 
 		 421 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  25.61 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 410 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 414 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  31.06 
 
 		 410 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0886  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  29.43 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0948  D-amino-acid dehydrogenase  30.65 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 415 aa  141  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3504  D-amino-acid dehydrogenase  31.95 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 419 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3589  D-amino-acid dehydrogenase  30.21 
 
 		 424 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0959455  hitchhiker  0.00000935542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.77 
 
 		 415 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.48 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0309  D-amino-acid dehydrogenase  33.56 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>