More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3970 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 411 aa  823    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  66.18 
 
 		 411 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  65.94 
 
 		 411 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  39.16 
 
 		 423 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 427 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  37.1 
 
 		 427 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  33.33 
 
 		 427 aa  244  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 420 aa  233  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.31 
 
 		 421 aa  229  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 425 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 423 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  39.15 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 412 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  36.21 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  31.81 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  36.21 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 		 416 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 413 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  35.93 
 
 		 420 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 430 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  33.74 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  31.67 
 
 		 422 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  34.3 
 
 		 416 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  34.35 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 416 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  33.59 
 
 		 424 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 415 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 424 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  29.98 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  32.03 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  32.6 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  31.91 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 		 426 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.44 
 
 		 428 aa  183  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 435 aa  183  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  30.17 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  30.4 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  33.66 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  29.29 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  31.12 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  32.57 
 
 		 413 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  28.85 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  34.12 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  33.8 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  32.06 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 440 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  30.86 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 415 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  31.59 
 
 		 438 aa  162  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  34.06 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  30.88 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  27.49 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.15 
 
 		 428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1817  D-amino-acid dehydrogenase  33.64 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.904553  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.36 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 430 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.01 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 446 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  27.25 
 
 		 416 aa  145  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 416 aa  145  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  28.54 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 414 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 437 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.82 
 
 		 433 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  27.41 
 
 		 417 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  29.51 
 
 		 413 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  29.51 
 
 		 413 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>