More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3651 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 426 aa  838    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  69.43 
 
 		 423 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  61.61 
 
 		 435 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  54.44 
 
 		 424 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  55.64 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  54.21 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  53.27 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  49.52 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  46.28 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  44.89 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  43.74 
 
 		 421 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  39.18 
 
 		 415 aa  278  9e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  36.75 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  40.91 
 
 		 423 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  38.42 
 
 		 412 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 		 416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  37.92 
 
 		 423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 		 425 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  35.56 
 
 		 416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  36.67 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 410 aa  222  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  35.49 
 
 		 416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  33.17 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  35.87 
 
 		 420 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  38.33 
 
 		 413 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.9 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  34.38 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  37.89 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  37.89 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  33.82 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  38.96 
 
 		 406 aa  217  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 414 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  38.33 
 
 		 413 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 411 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 411 aa  203  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 432 aa  199  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 411 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  34.45 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 427 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  31.04 
 
 		 446 aa  189  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  34.27 
 
 		 420 aa  189  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  32.31 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  30.68 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 430 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 415 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  33.01 
 
 		 417 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  33.01 
 
 		 417 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 430 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  33.33 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 416 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 417 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  32.21 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  31.82 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  33.02 
 
 		 416 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  30.9 
 
 		 418 aa  153  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  31.06 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  32.79 
 
 		 416 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  32.71 
 
 		 413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  28.01 
 
 		 416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 414 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.75 
 
 		 415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0886  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 439 aa  146  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 413 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  27.94 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  32.71 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  28.11 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  31.69 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>