More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1218 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 415 aa  853    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  46.56 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  45.19 
 
 		 415 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  45.87 
 
 		 415 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  45.12 
 
 		 415 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  45.41 
 
 		 440 aa  346  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  42.82 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  42.13 
 
 		 405 aa  315  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  42.75 
 
 		 420 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  42.96 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  42.93 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  39.9 
 
 		 422 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  38.16 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  35.85 
 
 		 423 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 		 427 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  37.03 
 
 		 431 aa  246  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 420 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 		 423 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  33.58 
 
 		 416 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  32.12 
 
 		 415 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.49 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 409 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  33 
 
 		 413 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  34.13 
 
 		 409 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  34.13 
 
 		 409 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 413 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  30.69 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  32.5 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 416 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  29.61 
 
 		 415 aa  189  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 435 aa  189  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  29.76 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.91 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  29.85 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 424 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  31.81 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  30.19 
 
 		 433 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 416 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 416 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  29.79 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  32.01 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  32.47 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  27.76 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  29.05 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  29.41 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  29.18 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  31.86 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 411 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  28.2 
 
 		 416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  29.09 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  27.79 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  27.73 
 
 		 416 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 423 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 414 aa  156  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  28.71 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  29.64 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 414 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  28.33 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  28.13 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 415 aa  150  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3940  D-amino-acid dehydrogenase  27.92 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401149  hitchhiker  0.00412438 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  28.24 
 
 		 414 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  28.24 
 
 		 414 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 416 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 420 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 417 aa  143  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 414 aa  143  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 441 aa  142  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.17 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>